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목록싱글셀 batch correction (1)
바이오 대표
[single cell Analysis] 싱글셀 분석 기본 다지기 2 - normalization & batch correction
해당 글은 지마님의 블로그의 Batch effect https://ruins880.tistory.com/88 를 참고하였습니다. 좀 더 자세한 사항은 지마님의 블로그를 참고바랍니다. Normalization vs Batch effect correction in scRNAseq Normalization: 라이브러리 제작, dropout, 유전자 길이, GC 비율 등에 따른 증푹 치우침 (amplification bias) - raw count matrix 이용 Batch Effect correction: 실험 설계 및 실험 과정 (시퀀싱 기계, 실험 시각, 시약, 실험실) 에서 오는 변이 통제 - 차원이 축소된 데이터 이용 (계산 시간 줄이기 위하여) ⇒ batch effect 가 제거된 결과는 차원이 축..
Bioinformatics/NGS 기본지식
2023. 2. 20. 09:02