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데이터를 시각화 하는 것은 의미 있는 해석을 하기 위해 중요한 단계입니다. 해당 글에서는 R 언어을 이용해서 히트맵을 그리는 다양한 패키지 중 (pheatmap, ggplot, complexheatmap) 중 파라미터들를 이용해서 이쁘게 그릴 수 있는 complexheatmap()에 관하여 알아보겠습니다. ComplexHeatmap heatmap을 그릴 때, 필요한 요소는 matrix 입니다. 하지만 좀 더 이쁜 그림을 위해 다음과 같은 요소들을 사용할 수 있습니다. 필수! matrix (ex. gene vs sample counts) 선택 color heat_colors colorRamp2 선택 column annotation colanno HeatmapAnnotation 선택 row annotatio..

Matplotlib Heatmap 히트맵 정리 1~ 8 에서 python matplotlib.pyplot 의 전반적인 설명과 plotting plt.plot( ), marker, line, label, grid, subplot, scatter, bars plot, pie chart 에 대해서 살펴보았습니다. 이번 글에서는 해당 라이브러리로 Heatmap 히트맵 에 대한 설명합니다. histogram plt.matshow( ) or plt.imshow( ) color bar plt.colorbar( ) color limit plt.clim( , ) colar map plt.get_camp('') Heatmap 히트맵 그리기 Heatmap 히트맵은 숫자 데이터를 분포를 색상을 이용해서 시각화 한 것이다. 나..