일 | 월 | 화 | 수 | 목 | 금 | 토 |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2 | 3 | 4 | |||
5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 |
12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 |
19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 |
26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 |
Tags
- single cell analysis
- 싱글셀 분석
- js
- CUTandRUN
- ChIPseq
- julia
- PYTHON
- cellranger
- 비타민 C
- HTML
- DataFrame
- python matplotlib
- pandas
- single cell
- CSS
- drug development
- Batch effect
- single cell rnaseq
- scRNAseq
- ngs
- github
- Bioinformatics
- Git
- drug muggers
- MACS2
- javascript
- EdgeR
- CUT&RUN
- scRNAseq analysis
- matplotlib
Archives
- Today
- Total
목록히트맵 색 변경 (1)
바이오 대표
[ R 시각화 ] R 언어로 그리는 이쁜 히트맵 (Heatmap) - complexHeatmap
데이터를 시각화 하는 것은 의미 있는 해석을 하기 위해 중요한 단계입니다. 해당 글에서는 R 언어을 이용해서 히트맵을 그리는 다양한 패키지 중 (pheatmap, ggplot, complexheatmap) 중 파라미터들를 이용해서 이쁘게 그릴 수 있는 complexheatmap()에 관하여 알아보겠습니다. ComplexHeatmap heatmap을 그릴 때, 필요한 요소는 matrix 입니다. 하지만 좀 더 이쁜 그림을 위해 다음과 같은 요소들을 사용할 수 있습니다. 필수! matrix (ex. gene vs sample counts) 선택 color heat_colors colorRamp2 선택 column annotation colanno HeatmapAnnotation 선택 row annotatio..
R
2023. 8. 4. 07:29