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목록DE analysis (1)
바이오 대표
[ RNA-seq DE Analysis ] EdgeR/limma (COVID-19 vs Health)
EdgeR 은 RNA counts data로부터 DE (Differential Expression) Analysis 를 진행한다. EdgeR 이 제공하는Functions: DGEList - 데이터를 효율적으로 사용할 수 있도록, List-based data 태로 변환 ([1] counts [2] samples) filterByExpr cacNormFactors estimateDisp ### Covid- 19 Patients vs Healthy Control DE Analysis ### 해당 글에서 다룰 DE (differntial Expression) Analysis 는 4가지의 실험중 RNA-Seq data 를 R bioconductor edgeR 을 이용한 실험이다. 17 명의 Covid-19 pa..
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2022. 1. 26. 18:58