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목록Data Integration (1)
바이오 대표
[scRNAseq 논문] 싱글셀 Seurat v4 (“Integrated analysis of multimodal single-cell data” 2021
Introduction Mutimodals 을 이용한 싱글셀 분석. 해당 논문에서는 “weighted-nearest neighbor(WNN)” 을 이용하여 integrate multiple data types (joint definition of cellular states)를 구한다. WNN 은 각 cell-specific modality weights를 구하는 unsupervised learning 이다. Results 대부분 CITE-seq을 기준으로 진행하였다. CITE-seq을 이용하면 scRNAseq 데이터와 세포 표면에 붙어있는 protein들의 정보를 알 수 있다. 여러 modality를 이용했을때, 각 세포를 더 잘 reflect 할 수 있는 modality 에 더 큰 weight 부여해..
논문
2023. 3. 13. 07:15