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[ NSG QC / trimming ] TrimGalore

nextflow 를 이용하여 RNA-seq을 진행하기 위하여 사용하였다. Trim Galore Function: FastQ 파일은 일정하게 QC 하고 trimming 하기 위한 툴. warrper tool of Cutadapt and FastQC + some functions for RRBS type library *Cutadapt: adapter seq, primers, poly-A-tail 등 제거 *FastQC: High throughput sequencing data QC Step 1: Quality Trimming low-quality reads trimmed off using phred quality score Step 2: Adapter Trimming Default: 13pb of Illu..
Bioinformatics/Tools 2023. 2. 14. 04:39
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