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[Bioinformatics 논문] TIN score 이용하여 RNA degradation 계산 “Measure transcript integrity using RNA-seq data”

“Measure transcript integrity using RNA-seq data” Feb.2016 Abstract RNAs 데이터는 보통 archived (저장되어있던) clinical tissue 에서 추출하는데 꽤 degraded 한모습을 보인다. RNA degradation은 RNA-seq read coverage를 왜곡하기도 하고, whole-genome gene expression profiling 에 심각한 영향을 끼치기도 한다. Result TIN (transcript integrity number) 을 이용해서 RNA degradtion 을 measure 할 수 있다. Calibrating gene expression counts with TIN scores 를 통해서 by fals..
논문 2023. 2. 3. 04:59
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