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바이오 대표
[ Deeptools ] DBS(differential binding sites) 를 Deeptools의 ComputeMatrix와 plotHeatmap을 이용해서 시각화하기
DBA (Differential Binding sites) visualization Chipseq 이나 Cut&Run, Cut&Tag 기술을 이용해서, target antibody가 붙는 sequence 정보를 얻을 수 있고 어느 지역에 더 많이 붙는지 DBA(differential binding sites analysis) 분석을 할 수 있다. 해당 글에서는 DBA(differential binding analysis) 로 확인된 지역을 Deeptools 의 computeMatrix 와 plotHeapmap을 이용하여 시각화 할 것이다. Step 1. bigWigMerge (ucsc-bigwigmerge v377) multiple bigWigs → A single Bedgraph file bigWigM..
Bioinformatics/Tools
2023. 7. 11. 09:21