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[싱글셀 multiome 논문)“Dictionary learning for integrative, multimodal and scalable single-cell analysis” 2023

요약 보통 reference cell type annotation은 scRNAseq의 gene expression 을 기반으로 만들어졌다. 따라서 새로운 데이터의 scRNAseq을 annotate하는 것은 어느정도 쉽지만 다른 modality 갖는 데이터, 즉 gene expression이 아닌 정보를 갖는 데이터 (scATACseq, scCUT&Tag, CyTOF-protein)를 annotate하는데는 어려움이 있다. 따라서 해당 논문에서는 “dictionary learning” 기술을 이용한다. 쉽게 설명하자면 예를 들어, [1] RNA+ATAC정보를 담고있는 10x multiome 을 bridge로 이용하는 것이다. 현존하는 [2] RNA annotated reference 를 [1]scRNA+s..
논문 2023. 6. 11. 11:08
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