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바이오 대표
[ Peak Annotation] HOMER 이용하여 Peak annotation 하기 - annotatePeaks.pl/loadGenome.pl
HOMER 을 이용해서 Peak annotation 하는 방법 HOMER v4.11 annotatePeaks.pl > BED 파일 이나 HOMER peak files BED files 는 최소 6개의 칼럼으로 구성되어야 한다고 하지만 column 4 개(chr, start, end, strand) 도 허용한다. Column1: chromosome Column2: starting position Column3: ending position Column4: Unique Peak ID Column5: not used Column6: Strand (+/- or 0/1, where 0="+", 1="-") HOMER peak files (TAB으로 분리되는 txt files 형식) Column1: Unique P..
Bioinformatics/Tools
2023. 5. 16. 08:42