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바이오 대표
[ R 시각화 ] R 언어로 그리는 이쁜 히트맵 (Heatmap) - complexHeatmap
데이터를 시각화 하는 것은 의미 있는 해석을 하기 위해 중요한 단계입니다. 해당 글에서는 R 언어을 이용해서 히트맵을 그리는 다양한 패키지 중 (pheatmap, ggplot, complexheatmap) 중 파라미터들를 이용해서 이쁘게 그릴 수 있는 complexheatmap()에 관하여 알아보겠습니다. ComplexHeatmap heatmap을 그릴 때, 필요한 요소는 matrix 입니다. 하지만 좀 더 이쁜 그림을 위해 다음과 같은 요소들을 사용할 수 있습니다. 필수! matrix (ex. gene vs sample counts) 선택 color heat_colors colorRamp2 선택 column annotation colanno HeatmapAnnotation 선택 row annotatio..
[ matplotlib #6 ] Python matplotlib.pyplot 기본 코드 한번에 정리_6 (Scatter 산점도)
Matplotlib Scatter 정리 1~ 5 에서 python matplotlib.pyplot 의 전반적인 설명과 plotting plt.plot( ), marker, line, label, grid, subplot에 대해서 살펴보았습니다. 이번 글에서는 해당 라이브러리로 그래프의 Scatter 즉 산점도 그래프에 대한 설명합니다. scatter plt.scatter( ) colormap cmap='viridis' colormap 보이기 plt.colorbar( ) Scatter Plot 산점도 그래프 그리기 scatter plot은 데이터를 관찰 할 때, 전체적인 분포도를 보기 위하여 각 개체를 점으로 표시하여 나타낸 그래프입니다. 보통 두 개의 변수의 동시분포를 볼 수 있습니다. (두 개 이상도 ..