| 일 | 월 | 화 | 수 | 목 | 금 | 토 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | ||||||
| 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 |
| 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 |
| 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 |
| 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 |
Tags
- Git
- 싱글셀 분석
- EdgeR
- python matplotlib
- ngs
- Batch effect
- HTML
- pandas
- MACS2
- single cell
- scRNAseq
- matplotlib
- scRNAseq analysis
- javascript
- 비타민 C
- github
- CSS
- js
- julia
- CUT&RUN
- CUTandRUN
- ChIPseq
- cellranger
- drug muggers
- single cell rnaseq
- Bioinformatics
- single cell analysis
- DataFrame
- drug development
- PYTHON
Archives
- Today
- Total
목록Boolean models (1)
바이오 대표
[ 싱글셀 논문 ] Gene Network 모델 (SCENIC vs WGCNA) “Single-cell network biology for resolving cellular heterogeneity in human diseases” (2020)
Single-cell network biology Network 찾는 방법 Bulk RNAseq 에서는 Boolean networks, Bayesian networks, ordinary differential equations (ODEs), information theory, regression, and correlation18,19,20 와 같은 방법이 사용되었습니다. scRNAseq 에서도 위의 방법 사용 가능하지만, 싱글셀로만 얻을 수 있는 정보를 이용하기도 합니다. 예로, trajectory analysis (psueotime 정보) 를 기반으로 하는 방법이 있습니다. 즉, 세포들이 특정 developmental/differentiation 상태에 있다고 가정하고 시간대로 나열한, time-ord..
논문
2023. 7. 22. 03:51