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목록Drug (54)
바이오 대표
[ SMILES ] CNN based on SMILES representation of compounds for detecting chemical motif
다양한 fingerprint 와 graph convooution architecture을 이용한 DL 모델 발전. 하지만 이는 (1)분자 비대칭성(chirality of compounds), (2) effective feature을 발견하느냐에 따라 효과적일수도있고 아닐수도 있다. Model: CNN (input = SMILEs notation) Goal: Compounds Classification (Chemical Motif detection with the learned feature) dataset: TOX 21 dataset SMILES 장점: Linearly represents 로써 low dimensional representation 이다...
Drug
2021. 10. 12. 21:59
[ Drug Development ] CheMBL DB & PubChem을 이용한 DRUG 후보 뽑아내기
## DB 데이터베이스와 ML 을 이용한 target 에 적합한 chemical compound (drugs) 찾기 - CheMBL *chemical "SMILES" : simplied molecular-input line entry system (molecule들의 구조 structure 을 컴퓨터가 인식하기 쉽고 문자열로 나타낸 것) - Descriptors 이용 가능 ex) Lipinski descriptors 를 이용해서 먹는 약 (orally active drug)가 될 자격이 있는지 확인 가능 Lipinski descriptors 포..
Drug
2021. 10. 4. 22:28