일 | 월 | 화 | 수 | 목 | 금 | 토 |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | ||||||
2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 |
9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 |
16 | 17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 |
23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 |
30 | 31 |
- ngs
- drug development
- CSS
- pandas
- julia
- cellranger
- single cell rnaseq
- single cell
- CUTandRUN
- PYTHON
- drug muggers
- matplotlib
- js
- HTML
- Bioinformatics
- javascript
- ChIPseq
- CUT&RUN
- Git
- scRNAseq analysis
- Batch effect
- 비타민 C
- single cell analysis
- scRNAseq
- 싱글셀 분석
- EdgeR
- python matplotlib
- github
- MACS2
- DataFrame
- Today
- Total
목록논문 (30)
바이오 대표

"pre-trained Bidirectional Encoder Representations from Transformers model for DNA-language in genome" Feb 2021 Abstract (해당 논문은 가짜연구소에서 알게된 지인의 관심사로 인해 읽어보았다. sequencing 이후에 서열 해석을 위해 NLP를 사용하는 것이다.) Motivation: non-coding DNA 를 해독하는 것은 유전체 연구에서 주 문제중 하나이다. Gene regulatory code (유전자 조절 코드)는 gene 의 여러 방면으로 해석이 가능하고 (polysemy), 멀리 떨어진 유전자와도 연관성이 있어 (distant semantic relation ship) 같이 아주 복잡하다. 이런한..
" Genome-wide meta-analysis of insomnia prioritizes genes associated with metabolic and psychiatric pathways " 07 2022 Abstract Insomnia (불면증) 은 유전적이고, 꽤 일반적이지만 충분한 치료법이 없는 수면장애이다. 130만명을 대상으로 한 genome-wide association studies(전체 유전체 상관분석연구)에서 200개가 넘는 관련 loci(chromosome에서의 유전자 위치)들을 식별해 내었다. 이러한 polygenicity(다인자성)는 아직 더 많은 loci들이 발견되지 않았다는 것을 뜻한다. 현재 연구는 샘플 사이즈를 거짓 두 배 증가하였고 (593,724 samples & ..
" PK/PD modeling and simulations: utility in drug development " Abstract Pharmacokinetic/pharmacodynamic (PK/PK) (약력학, 약동학) modelling 그리고 simulation (시뮬레이션)은 적은 비용으로 효과적이고 안전한 새로운 약을 빠르게 개발할 수 있도록해준다. PKPD modelling 은 전임상부터 모든 임상 phase에서 사용 될 수 있다. PKPD modelling 과 시뮬레이션을 가장 잘 활용하는 것은 failed compunds 나 failed study 를 줄이는 것이다. 신약 개발에서 PKPD modelling 이 이러한 잠재력을 이행하기 위해서는 산업, 규제기관들에서의 수용과 관련 교육이 필요..

" Understanding and applying pharmacometrics modeling and simulation in clinical practice and research " Abstract 임상약리학에서의 핵심요소는 dose-concentration-effect(투여량-농도-효과) 관계를 이해하는 것이다. 이 관계들을 관찰하면서 얻은 데이터들을 해석하기위해서는 수학적 모델을 필요로 한다. PK(pharmacokinetic - 약력학) 과 PD (pharmacodynamic - 약동학)가 가장 흔이 쓰이는 모델들이다. PK는 dose(투여량)과 concentration(농도)의 관계를 보기위한 모델이고, PD 는 concentration(농도)와 effect(효과)의 관계를 보기위한 모델이다..